万基联合GenomeCare无创文章发表

发布日期:2019-12-27信息来源: 厦门万基生物科技有限公司

目的:
该研究的目的是使用基于微阵列芯片的单核苷酸(SNP)多态性测量从母体血浆分离的cell free DNA(cell free DNA)来评估基于信息学的无创性产前亲子鉴定(胎儿亲子鉴定)的诊断准确性。
方法:
从21名成年孕妇(胎龄在6至21周龄)取血样,从相应的生物学父亲中取出遗传样品。亲子性通过在体外受精期间对婴儿的基因检测,受孕产品,受精控制和/或植入前基因诊断进行确认。使用HumanCytoSNP-12微阵列芯片扩增并分析亲本DNA样品和母体无浆细胞的DNA。基于信息学的方法测量单核苷酸多态性数据,确认或拒绝亲子关系。具有足够胎儿cell free DNA分数的每个血浆样品独立地针对确认的父亲和1,820个随机的不相关的男性数据进行测试。
结果:
21个样品中有一个没有足够的胎儿cell free DNA。当对生物父亲进行测试时,该测试正确证实了其余20个样品(100%)的亲子关系,P值<10 -4。对于使用不相关男性作为所谓父亲的36,400次测试,99.95%(36,382)正确排除了亲子关系,0.05%(18)是不确定的。没有任何错误。
结论:
使用单核苷酸多态性微阵列芯片测量的基于信息学分析的胎儿亲子鉴定在妊娠早期准确确定亲子关系。
关键词:胎儿,无创,亲子鉴定,产前
介绍
可靠的产前亲子鉴定需要直接进行绒毛膜取样或通过羊膜穿刺进行羊水取样,这两者都会增加对母亲和胎儿造成伤害的风险。羊膜穿刺术的流产风险为1 / 300-1 / 500(参考文献1),其他并发症的风险很小。2,3绒毛取样进行了类似的流产风险和胎儿四肢减少缺陷的1/3000的风险,尤其是当将10周妊娠之前进行。4,5虽然美国妇产科学会建议将这些程序提供给所有孕妇,1 当母亲处于遗传缺陷的高风险时,如积极的第一孕期筛查后,它们最常用。
母亲血液中胎儿cell free DNA(cfDNA)的发现表明可以开发胎儿亲子鉴定,这将避免与有创操作相关的风险。6虽然胎儿cfDNA在母体循环最初报道十多年前以上,6,7,8使用孕妇外周血一种可靠的,非侵入性的亲子测试的发展已经证明难以实现,因为胎儿cfDNA通常包括在总cfDNA的<20%母亲血浆并且高度分散。9胎儿cfDNA的有限数量及其通过母体cfDNA的重度稀释存在重大技术挑战。这些可以通过将微微阵列芯片或高通量测序(其测量数十万至数百万个DNA片段)与复杂的生物信息学技术结合以从母体血浆cfDNA测量获得的有限胎儿基因型数据中提取最大信息来克服。
我们之前曾报道过这种称为亲本支持的方法,该方法使用来自母本和父本DNA的单核苷酸多态性(SNP)芯片测量来提高噪声胚胎DNA基因型测量的保真度。10虽然这种方法精确地在单个胚胎细胞的所有24条染色体倍性标识,它并没有被用于亲子鉴定。
在这里,我们使用家长支持算法的一个版本来确定从母体血浆分离的cfDNA所做的cfDNA SNP测量的胎儿组分是否可能是由于所谓的父亲造成的。我们报告了21名孕妇测试这种新方法的结果,每个样本独立测试了确认的父亲以及1,820名无关个人。我们在怀孕6周后就能以100%的准确性鉴定亲子关系。

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